Overview

BacSeq 또는 FunITS 서비스는 검증된 라이브러리와 리포팅 프로세스를 구축하고, cGMP를 준수할 수 있도록 최적화하여 미생물 염기서열 데이터를 분석합니다. DNA 염기서열이 분석되면, 분석 데이터는 알려진 미생물의 라이브러리로 연관성을 비교한 후 동정 리포트를 생성하고 해석합니다.

염기서열의 해석, 라이브러리 비교, 리포트 생성은 프로세스의 중요한 부분입니다. 보편적으로 적용할 수 있는 해석 규칙은 없습니다. 종(species)의 cutoff는 속(genus)마다 다르며 때때로 특정 속에 포함된 종들은 매우 밀접하게 관련되어 있지만 (즉, 가까운 유전적 거리), 다른 속의 종들은 멀리 떨어져 있습니다. (즉, 먼 유전적 거리). 이런 거리 차이로 인해 하나의 유전적 거리 cutoff만을 사용해서는 종 해석이 불가능합니다. 먼저 유전적 거리가 가장 근접하게 일치하는 것을 살펴본 다음, 그 거리가 평균적으로 특정 속의 알려진 종들을 구분하는 거리와 동일한지 그 이하인지를 판단해야 합니다. 따라서, 찰스리버 미생물 계통발생학자의 교육과 경험은 정확한 동정을 위해 매우 중요합니다.

미생물 동정 라이브러리

찰스리버는 관련 산업계에서 가장 정확한 동정 결과를 제공하기 위해 노력하고 있습니다. 그 일환으로 분류학적 변화와 새로운 종이 매일 기술되어 진화하는 미생물학 세계에서 가장 최신의 상태를 유지하기 위해 Accugenix® 라이브러리를 지속적으로 업데이트 합니다.

찰스리버에서는 최고 수준의 동정 서비스를 위해 고객이 의뢰하는 세균과 진균 샘플에 대한 동정율을 정기적으로 평가합니다. 동정 서비스의 목표는 가장 높은 비율의 종 수준 동정을 달성하는 것이므로, 종 수준으로 매치되지 않는 샘플의 염기서열 데이터는 공개적으로 이용 가능한 다양한 염기서열 데이터와 비교합니다. 새롭게 기재된 미생물이 샘플의 염기서열과 잘 매치되고 유효하게 명명된 경우, 해당 염기서열은 찰스리버의 라이브러리 등록 과정으로 진행되어 광범위한 시험과 검토를 거친 후 Accugenix® 라이브러리에 업데이트 됩니다.

PRODUCT/SERVICE MATERIALS

• Creating and Maintaining Validated Microbial Identification Libraries
• Accugenix Libraries e-guide